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精(jing)準剖析sRNA

Small RNA(主要包(bao)括miRNA、piRNA、siRNA)調控靶xie)蟣biao)達,

參與生長發育過程和疾(ji)病發生發展,小RNA 測(ce)序可快速鑒定(ding)出(chu)已知(zhi)和未(wei)知(zhi)的小RNA,

為研xin)啃NA 的功能及調控機制提供有力工具。

專業項目方案設(she)計 深(shen)度解析數據

從(cong)選(xuan)材到後續研xin)磕諶rong)相關信息的挖掘,整個流程嚴謹(jin)進行xiao) quan)程跟蹤。

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樣本要求

1

分(fen)析路線

3

個性化(hua)分(fen)析8小時雲交付,項目進展透(tou)明化(hua),盡享極致體驗!

實時追蹤項目進展,一切動向(xiang)盡在掌握。

意見直(zhi)接反饋項目經理,高效(xiao)解決。

可對在線項目各維度的服務進行評價。

5

項目經驗豐(feng)富,碩果累累

公(gong)司(si)成立八年以來,擁有豐(feng)富的nan)yi)學(xue)項目分(fen)析經驗,累計完成5千多(duo)個樣品的nan)yi)學(xue)轉錄(lu)調控研xin)/p>

醫(yi)學(xue)物(wu)種涉(she)及人、鼠(shu),樣本類型包(bao)括常見組織或(huo)細胞(bao),以及體液(ye)、毛囊(nan)等特殊樣本

公(gong)司(si)擁有 40 余項專利技術(shu)和 150 余項軟件著(zhu)作權,根據項目需要選(xuan)擇(ze)方案,保障結果精(jing)準

50+項目分(fen)析人員

深(shen)度數據挖掘

豐(feng)富的nan)金糠fen)析案例

優化(hua)的交互式報告

8年+項目分(fen)析經驗

專業而熱情(qing)的售後服務

三個分(fen)布式集群服務器

閃電般的分(fen)析速度

結果展示

Small RNA篩選(xuan)

由于Dicer黴和DCL黴的特異性,最終生成的mou)墑iRNA長度主要集中在20nt到24nt的範(fan)圍內,動物(wu)的miRNA以22nt為主,通(tong)過軟件分(fen)析鑒定(ding)出(chu)的nan)閻zhi)miRNA和新miRNA。

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lncrna-5-400400

Small RNA堿基編輯分(fen)析

miRNA存在轉錄(lu)後堿基的編輯,導致種子(zi)序列(lie)xiao)eed sequence)改變,進而使(shi)得作用的靶xie)蚍?謀洹/p>

miRNA表(biao)達量(liang)總(zong)體分(fen)布

對各樣本中已知(zhi)和新miRNA進行表(biao)達量(liang)的統計,miRNA表(biao)達量(liang)總(zong)體分(fen)布圖可以反cong)逞分(fen)iRNA的整體表(biao)達模式。

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差(cha)異miRNA靶xie)蟯tong)路富集分(fen)析

分(fen)析差(cha)異表(biao)達miRNA靶xie)蛟諛mou)一通(tong)路上是否過出(chu)現(over-presentation)即為差(cha)異表(biao)達miRNA靶xie)虻athway富集分(fen)析。利用富集因子(zi)(Enrichment Factor)分(fen)析通(tong)路的富集程度,並(bing)利用Fisher精(jing)確檢驗方法計算(suan)富集顯著(zhu)性。

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研xin)啃NA需要提供什麼(me)樣品?

提供總(zong)RNA即可,針(zhen)對小RNA測(ce)序,會有相應的片(pian)段篩選(xuan),進行片(pian)段選(xuan)擇(ze)之(zhi)後,進行小RNA建庫,建庫采用針(zhen)對小RNA進口試(shi)劑盒。

miRNA是如何鑒定(ding)的?

miRNA轉錄(lu)起始位點(dian)多(duo)位于基因間(jian)隔(ge)區、內含子(zi)以及編碼序列(lie)的反向(xiang)互補序列(lie)上,其前體具有標志(zhi)性的發夾結構,成熟體的形成是由Dicer/DCL黴的剪切實現的。針(zhen)對miRNA的生物(wu)特征,對于比對到參考基因組的序列(lie)xiao) bai)邁(mai)客(ke)利用miRDeep2軟件和小RNA數據庫進行已知(zhi)miRNA及新的miRNA預測(ce)。

miRNA測(ce)序不做生物(wu)學(xue)重(zhong)復可以嗎?

考慮到實驗設(she)計原則,建議做生物(wu)學(xue)重(zhong)復。

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